Aastaid enne esimese mängu sündmusi suri traagilises majapõlengus Sebastiani tütar Lily. Vähemalt nii ta algselt arvas. The Evil Within 2 järgneb Sebastianile, kui ta reisib Unioni linna. Kuna Lily mõistus on oma loomise keskmes, on Union segu klaustroofsetest keskkondadest ja avatud aladest, mis on mängijate avastamiseks küpsed. Teilt oodatakse sellesse ebainimlikku maailma süvenemist, et päästa oma tütar kurjuse küüsist.
