„Star Fox“ komanda pergalingai grįžta į vieną didžiausių savo misijų, perdarydama „Star Fox 64“ visu 3D formatu. Visa „Star Fox“ visata tikroviškai išsiskleidžia „Nintendo 3DS“ ekrano gelmėse, o 3D vaizdai leidžia žaidėjui aiškiau suvokti atstumą ir padėtį. Dėl to žaidimas tampa prieinamesnis ir intuityvesnis, todėl žaidėjai gali sutelkti dėmesį į veiksmą. „Star Fox 64 3D“ taip pat leidžia naudoti du „Nintendo 3DS“ sistemos ekranus, kurių viršutiniame ekrane rodomas 3D žaidimas, o apatiniame ekrane rodomi įvairūs personažai ir jų dialogai.