Aastal 1615 tõuseb Jaapanis võimule uus Shogun, kes püüab tuua valdkonda rahu. Võitluses mässu vastu värbab ta mõrva, sabotaaži ja spionaaži jaoks viis erakordsete oskustega spetsialisti. Üks osa sellest meeskonnast on Hayato, väle ninja, kes puhastab mõõga ja shurikeniga vaikselt teed läbi oma vaenlaste. Samurai Mugen on veidi sirgjoonelisem ja suudab paindlikkuse arvelt korraga alistada rohkem vastaseid. Aiko on kamuflaažimeister, kui ta geishana vaenlaste tähelepanu hajutab ning tänavalaps Yuki seab lõksud ja meelitab vaenlased nende surmava saatuse poole. Takuma aga toetub oma snaipripüssile ja hoolitseb vaenlaste eest eemalt.
Selles reaalajas taktikamängus peab mängija oma võimalusi hoolikalt hindama, et väljakutseid pakkuvate ülesannete täitmiseks täita: kuidas tegelased meeskonnana käituvad? Milline neist on iga ülesande jaoks kõige paremini varustatud? Kuidas nad antud keskkondi kõige paremini valdavad? Mõelge välja oma geniaalne taktika vaenlaste võitmiseks ja missioonide lõpuleviimiseks.