„Metal Gear Solid Rising: Revengeance“ vyksta praėjus trejiems metams po „Guns of the Patriots“. Karas nebėra PMC verslas. Arba taip sako žmonės. Tačiau iš JAV nutekėjusi naujoji kiborgo technologija paverčia pusiausvyrą, o trapią taiką vėl drasko smurtas. Kiborgo kareivis Raidenas turi susidurti su savo stipriausiu priešu. Jį užpuola kiborgų armija iš Desperado Enforcements. Mūšio metu Raidenas praranda kairę akį ir kairę ranką. „Desperado“ perėmė Abhaasia kontrolę. Raideno įmonė „Maverick“ priima darbą iš Rusijos, kad atgautų šalį. Su atnaujintais šarvais ir galingesnėmis kiborgo dalimis Raidenas puola į priešo teritoriją kovoti su Desperado ir atkeršyti už jo garbę.