Alphadia Genesis pasakoja apie epinį nuotykį su Fray ir jo tyrimo komanda iš Archleign Kingdom, kai jie ketina išspręsti paslaptingą žmogžudystės bylą netoliese esančiame mieste. Po kai kurių pradinių tyrimų Fray ir jo bendražygius prisijungia delegatai iš Ghalzabine karalystės.
