Metal Gear Solid Rising: Revengeance leiab aset kolm aastat pärast Guns of the Patriots. Sõda pole PMCde jaoks enam äri. Või nii rahvas ütleb. USA-st välja imbunud uus küborgi tehnoloogia kallutab aga tasakaalu ja vägivald rebib taas habrast rahu läbi. Küborgsõdur Raiden peab silmitsi seisma oma seni tugevaima vaenlasega. Teda ründab Desperado Enforcementsi küborgiarmee. Lahingu ajal kaotab Raiden vasaku silma ja vasaku käe. Desperado on Abhaasia üle kontrolli võtnud. Raideni firma Maverick võtab Venemaalt töö vastu, et riik tagasi võtta. Uuendatud soomuse ja võimsamate küborgiosadega Raiden tungib vaenlase territooriumile, et võidelda Desperadoga ja maksta tema au kätte.
